Mezi kýly vyskytující se raritně řadíme tzv. vnitřní kýly , které vznikají vsunutím orgánu ( nejčastěji střeva ) do vývojem dané výchlipky pobřišnice v dutině břišní . Mohou se projevovat neurčitými bolestmi břicha , zejména po jídle . Obtížně se stanovuje jejich diagnoza , v případě náhlé příhody břišní se zjistí až během operačního zákroku . Mezi vzácné vnitřní kýly patří obecně také brániční kýly prostupující otvory v bránici z břicha do hrudníku , dále vzácné zevní kýly v defektech svalového dna pánevního či v atypických místech stěny břišní ( např. tzv. Spiegelova kýla )